ESXi5.0へのパッチのあて方。
こちら を参考にあてました。
ファイルは、
http://www.vmware.com/patchmgr/download.portal
から落とします。
ESXi 5.0.0 を選んで、searchをクリックして
ESXi500-201109001.zipを落としてきます。

VMware vSphere Clientのデータストア ブラウザ等を使い
データストアにコピーします。
後は、SSHなりコマンドラインから
# esxcli software vib install -d /vmfs/volumes/ データストア名/ESXi500-201109001.zip
 
暫く待つと
Installation Result
   Message: The update completed successfully, but the system needs to be rebooted for the changes to be effective.
   Reboot Required: true
   VIBs Installed: VMware_bootbank_esx-base_5.0.0-0.3.474610, VMware_locker_tools-light_5.0.0-0.3.474610
   VIBs Removed: VMware_bootbank_esx-base_5.0.0-0.0.469512, VMware_locker_tools-light_5.0.0-0.0.469512
   VIBs Skipped: VMware_bootbank_ata-pata-amd_0.3.10-3vmw.500.0.0.469512, VMware_bootbank_ata-pata-atiixp_0.4.6-3vmw.500.0.0.469512, VMware_bootbank_ata-pata-cmd64x_0.2.5-3vmw.500.0.0.469512, VMware_bootbank_ata-pata-hpt3x2n_0.3.4-3vmw.500.0.0.469512, (後略)

となるので、reboot。

Buildが5.0.0, 469512 から 5.0.0, 474610 に変わっていれば成功です。